영국령 인도에서 태어나고 자란 어린 소녀가 자기에게 무관심하던 부모를 지진으로 잃고, 10년 전 부인을 잃고 시름에 빠져 집을 멀리하는 이모부가 사는 영국의 미셀드와이트 저택으로 보내진다. 영국의 시골 지방에 도착한 소녀는 맑은 공기와 비옥한 토지, 건장한 하인을 만나 용기를 얻고 건강을 되찾는다. 같은 또래의 시종 소년과 함께 수년 간 잠겨있던 화원을 다시 일구던 소녀는 결국 그 저택의 또다른 비밀을 알게 된다. 세대를 뛰어넘는 영화인 비밀의 화원의 이야기는 이렇게 펼쳐지는데…